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根据《食品安全法》及其实施条例的规定，特医食品许可证的费用由卫生健康委员会及其授权的省级卫生健康行政部门制定并公布。
目前，不同省份的特医食品许可证费用存在一定的差异。以南宁市为例，特医食品许可证的收费标准如下
1. 申请特医食品许可证，收费标准为2000元/件。
2. 申请特医食品注册证，收费标准为5000元/件。
需要注意的是，特医食品许可证的费用并不是一次性收取的。申请人需要在提交申请材料时缴纳一定的费用，但在审批过程中如果需要补充材料或者重新提交申请，可能还需要再次缴纳费用。
此外，申请人在申请特医食品许可证时还需要承担相关的检测、认证等费用。因此，申请特医食品许可证的总费用可能会比较高。
总的来说，特医食品许可证的费用因地区而异，申请人在申请时需要仔细了解当地的收费标准，以免造成不必要的经济负担。
